До назначения Никита Стасишин занимал должность директора Департамента жилищной политики Минстроя России. В ведомстве он работает с момента его создания - с ноября 2013 года. Карьеру в Минстрое России Никита Стасишин начал с должности заместителя директора Департамента жилищной политики, начальника отдела методологии и реализации программ и проектов в сфере жилищной политики.
Ранее он возглавлял управление Федерального агентства по строительству и жилищно-коммунальному хозяйству. Также в послужном списке значится ГУП Московской области «Московский областной дорожный центр».